وُلدَ في إقليم توسكانا في إيطاليا. انتُخب أسقفًا على مدينة رومة عام 523. في ذلك الوقت كانت إيطاليا تحت حكم الإمبراطور الآريوسي المذهب تيودوريقُس، الذي أجبر البابا يوحنا أن يذهب إلى القسطنطينية ليُقنع الإمبراطور يوستينُس بأن يتراجع عن قراره ضدّ الآريوسيّة. فاستُقبل البابا بحفاوة شديدة في القسطنطينية، إلّا أنه لم يُتمّ المهمة الموكَّلة إليه لأنها كانت تتعارض مع إيمانِه القويم. لذلك ألقاه الإمبراطور في سجن مدينة رافينّا حالَ عودته، فمات فيه جوعاً عام 526. يُذكر بأن التأريخ الميلادي، أي حساب السنين بدءًا من ميلاد المسيح، الذي ما زال يُستخدم حتى أيّامنا هذه، قد نشأ عهد حبريّة لهذَا البابا القدّيس.